Khi ruồi đậu, bu bám, bò đi tìm kiếm thức ăn ở những nơi bẩn thỉu có mầm bệnh thì cơ thể của chúng có thể mang mầm gây bệnh. Nếu mầm bệnh chỉ dính vào bề mặt ngoài của cơ thể thì chúng sống sót chỉ vài giờ. Khi mầm bệnh cùng với thức ăn được ruồi nuốt vào dạ dày hoặc ruột thì có thể tồn tại sau vài ngày. Khi ruồi tiếp xúc với người và các loại thức ăn của người, mầm bệnh từ ruồi sẽ xâm nhập và gây bệnh. Đa số mầm bệnh do ruồi truyền đều bị nhiễm trực tiếp qua đường thức ăn, đồ uống, không khí, bàn tay...

Ruồi không chỉ gây phiền phức mà còn mang theo các vi trùng, vi khuẩn từ những nơi kém vệ sinh nhất tới nguồn thức ăn của con người thông qua đặc điểm sống của chúng. Ruồi có thể gây ra những bệnh do ruồi truyền thường là các bệnh truyền nhiễm qua đường tiêu hóa như ngộ độc thức ăn, kiết lỵ, tiêu chảy, lỵ trực trùng, lỵ amíp, tả, thương hàn, giun, sán, bệnh ngủ... Ngoài ra còn bị một số các bệnh khác như nhiễm trùng mắt (đau mắt hột, ), mắt hột, mụt cóc, bệnh ngoài da cấp tính, nấm, phong...

Vì vậy trong đời sống và sinh hoạt của con người, nhất là sau các đợt lũ lụt, môi trường bị ô nhiễm nặng, cần có các biện pháp truyền thông giáo dục, vận động người dân ở cộng đồng nâng cao nhận thức trong việc phòng bệnh bằng cách làm giảm các mối liên quan, tiếp xúc với ruồi có khả năng mang mầm bệnh.

Ghi chú:

 Bệnh ngủ: Do ruồi Tsetse gây ra. Bệnh chủ yếu xuất hiện ở Châu Phi. Mỗi năm gây ra khoảng 60.000-70.000 người chết tại Châu Phi